Het hoogste bestuursorgaan binnen de vereniging CNV is de Algemene Vergadering (AV). De Algemene Vergadering bestaat uit vertegenwoordigers van de bonden die bij het CNV zijn aangesloten.

De AV kiest de leden van het Dagelijks Bestuur, onder wie de voorzitter van het CNV. De AV stelt de strategische documenten van het CNV vast, zoals het Visieprogramma en het Bestuursplan. De Algemene Vergadering keurt daarnaast het jaarverslag en de jaarrekening van de vakcentrale goed. In de regel vergadert de Algemene Vergadering een keer per jaar in november.

Het Algemeen Bestuur van het CNV bestaat uit 14 leden. Elf leden worden aangewezen door de bonden, drie leden worden gekozen door de Algemene Vergadering. Elke CNV-bond wijst een AB-lid aan.

Het Algemeen Bestuur bepaalt de hoofdlijnen van het CNV-beleid. Dat gebeurt door het al dan niet goedkeuren van SER-adviezen, aanbevelingen van de Stichting van de Arbeid, e.d. Het AB geeft de koers aan die het CNV moet varen bij interne projecten op het gebied van samenwerking tussen bonden en de vakcentrale. Ten slotte keurt het Algemeen Bestuur de begroting van de vakcentrale goed.

Het Algemeen Bestuur ziet er als volgt uit:  

Dagelijks Bestuur CNV

Voorzitter - Jaap Smit
Algemeen Secretaris - Pieter de Vente